MOLEKÜLER BİYOLOJİ VE GENETİK ARAŞTIRMA GRUBU

Yürütücüler


ARAŞTIRMA GRUBU ÜYELERİ

Prof. Dr. Fikret IŞIK (North Carolina State University)

Prof. Dr. Hüseyin Avni ÖKTEM (Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Biyolojik Bilimler Bölümü)

Prof. Dr. Mahfuz ELMASTAŞ (Gaziosmanpaş Üniversitesi)

Prof. Dr. Nuray Kaya (Akdeniz Üniversitesi, Biyoloji Bölümü)

Prof. Dr. Meral Yücel (Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Biyolojik Bilimler Bölümü)

Doç. Dr. Behiye Banu BİLGEN (Namık Kemal Üniversitesi, Tarımsal Biyoteknoloji Bölümü)

Doç. Dr. Yusuf KURT (Harran Üniversitesi, Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü)

Dr. Öğr. Üyesi Abdullah Tahir BAYRAÇ (Karamanoğlu Mehmetbey Üniversitesi, Biyomühendislik Bölümü)

Dr. Öğr. Üyesi Abdussamat GÜZEL (Harran Üniversitesi, Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü)

Dr. Öğr. Üyesi Arif PARMAKSIZ (Harran Üniversitesi, Biyoloji Bölümü)

Dr. Öğr. Üyesi Hüseyin YÜCE (Marmara Üniversitesi, Teknoloji Fakültesi)

Dr. Öğr. Üyesi İlker ÇİNBİLGEL (Akdeniz Üniversitesi, Turizm Rehberliği Bölümü)

Dr. Öğr. Üyesi Oya AKÇA (Harran Üniversitesi, Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü)

Dr. Öğr. Üyesi Sedat ÇAM (Harran Üniversitesi, Biyoloji Bölümü)

Dr. Öğr. Üyesi Numan GÖZÜBENLİ (Harran Üniversitesi, Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü)

Öğr. Gör. Dr. Çiğdem GÜNGÖRMEZ (Harran Üniversitesi, Merkezi Araştırma Laboratuvarı)

MSc. Onur Bulut (Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Konya Gıda ve Tarım Üniversitesi)


ARAŞTIRMA KONULARI

  • Moleküler Biyoloji ve Genetik
  • Biyoteknoloji
  • Mikrobiyal Genetik
  • Gen Mühendisliği
  • Nanoteknoloji
  • Nanobiyoteknoloji
  • Moleküler Tanı Sistemleri
  • Nükleik Asit ve Protein tabanlı Arrayler
  • Biyosensörlerin Tıbbi ve Endüstriyel Uygulamaları
  • Biyokimya
  • Bitki Sekonder Metabolitlerinin İzolasyonu ve Etkileri
  • Bitki Abiyotik Stres Fizyolojisi, Antioksidan Savunma Mekanizmaları ve Gen İfade Değişimleri
  • Kanser Moleküler Biyolojisi
  • Bitki, Hayvan ve Mikroorganizma Moleküler Genetiği
  • Genomik ve Proteomik
  • Populasyon Genetiği


ETKİNLİKLER

  • KURT Y. and IŞIK K. 2018. Age-Age Correlations and Early Selection in Genetic Improvement of Forest Trees: Diameter Growth in Pinus brutia Ten. The 4th International Symposium on EuroAsian Biodiversity (SEAB2018), 03-06 July, Kiev, Ukrayna (Oral presentation).
  • KURT Y. and IŞIK K. 2018. Altitudinal Genetic Variation Among Pinus brutia Ten. Populations: Diameter Growth at Age 35-years at Two Test Sites on the Taurus Mountains. International Symposium on Ecology, 19-23June, Kastamonu, TURKEY (Oral presentation).
  • KURT Y. and CİNBİLGEL I. 2018. Application of R Software Packages to Flora and Vegetation Studies. 1st International Congress on Plant Biology, 10-12 May, Konya, Turkey (Oral presentation).
  • KURT Y., MATALLANA L., WHETTEN R. and FRAMPTON J. 2017. High-Throughput DNA and RNA extraction from trees. VI. International Molecular Biology and Biotechnology Congress, 22-25 December, Afyon, Turkey, pp. 48 (Oral presentation)
  • KURT Y. 2017. Using R Software Environment for Statistical Analysis. 2nd International Mediterranean Science and Engineering  Congress. 25-27 October, Adana, TURKEY, pp. 255 (Oral presentation).
  • KURT Y., ÇENGEL B. and IŞIK K.  2017. Forest Biodiversity and its Conservation Strategies in Turkey. Proceedings of the 5th International Conference on Conservation of Forest Genetic Resources, 02-07 October, Gomel, BELARUS, pp. 106-107 (Oral presentation).
  • KURT Y. and CİNBİLGEL İ. 2017. Traditional Oil Production from Lamiaceae species and Utilization of Oil by Local People in Akseki-İbradı-Manavgat Districts (Antalya-Turkey). The 3rd International Symposium on EuroAsian Biodiversity (SEAB2017), 05-08 July, Minsk, BELARUS, pp. 285 (Oral presentation).
  • CİNBİLGEL İ. and KURT Y. 2017. Species Diversity and Ethnobotanical Utilization of Lamiaceae in Akseki-İbradı-Manavgat Districts (Antalya-Turkey). The 3rd International Symposium on EuroAsian Biodiversity (SEAB2017), 05-08 July, Minsk, BELARUS, pp. 76 (Oral presentation).
  • KAYA N., KURT Y., ÇENGEL B., VELIOGLU E., DANIELS R.R., GRIVET D.G., et al. 2017. Determination of Genetic Diversity of Turkish Red Pine (Pinus brutia Ten.) and Aleppo Pine (Pinus halepensis Mill.) Populations by Chloroplast Simple Sequence Repeats, International Symposium On Biodiversity and Edible Wild Species (BEWS2017), Antalya, Turkey, 3-5 April 2017, pp.153-153(Oral presentation).
  • GÖZÜBENLİ N. 2017. Fabrication Technique for Nanobowls Based on LbL Technique by Polyurethane. 6 th International Molecular Biology and Biology Congress, Afyon (Oral presentation)
  • GÖZÜBENLİ N. 2017. Scalable fabrication of electrodes of tribo nanosensors based on highly uniformcolloidal nano arrays. International Congress on Advances in Bioscience and Biotechnology, Saraybosna, Bosna Hersek, (Oral presentation)
  • GÖZÜBENLİ N. 2017. Scalable Fabrication of Plasmonic Surfaces based on Nanolithography for Biosensing.  13 th Nanoscience and Nanotechnology Conference, Antalya, Turkey (Oral presentation)
  • GÖZÜBENLİ N. 2017. Large-Scale Colloidal Self-Assembly of Monolayer Nanostructures BasedPolyurethane.  8 th International Advanced Technologies Symposium, Elazığ, Turkey (Oral presentation)
  • AKÇA O., OKTEM H.A. “Optimization Of Sandwich Hybridization Conditions For Single Nucleotide Polymorphism (SNP) Detection On A Nucleic Acid Based Array Platform.” 1st Turkish Congress of One Health, Abstract book page 126, Konya, Turkey, April 8, 2015.
  • AKÇA O., OKTEM H.A. “Development Of A Silica Nanoparticle Based Platform For Single Nucleotide Polymorphism (SNP) Detectıon.” 1st Turkish Congress of One Health, Abstract book page 127, Konya, Turkey, April, 2015
  • AKÇA O, ÖZ MT, ÖKTEM HA “Oligonucleotide Ligation Mediated On-Chip SNP Detection” Biosensors 2012, 22nd Anniversary World Congress on Biosensors, Abstract Book P1.63, Cancun, Mexico, May 2012
  • BULUT O, AKÇA O., OKTEM HA “Development of a gold nanoparticle based nucleic acid lateral flow assay for detection of Salmonella”, 28th Anniversary World Congress on Biosensors, June 2018, Miami, Florida, USA (Accepted)
  • ARICI MK, BULUT O, AKÇA O, YÜCEL M, ÖKTEM HA “Salmonella Detection via Silica Nanoparticle based Lateral Flow Test Platform” 3rd International Congress on Biosensors, Hacettepe Üniversity, Ankara, October 2016.
  • BULUT O., AKÇA O., OKTEM HA. "Development of a Lateral Flow Assay Coupled with Conventional PCR for Detection of Salmonella." 1st Turkish Congress of One Health, Abstract book page 69, Konya, Turkey, April 2015.
  • Güzel, A., Elmastaş, M., Telci, İ. The Effect of Harvesting Time on The Phenolic Compound Composition of Satureja hortensis L. Plant. 1. Uluslararası Geleneksel ve Tamamlayıcı Tıp Kongresi. 19-22 Nisan 2018, İSTANBUL/TÜRKİYE)
  • Güzel, A., Elmastaş, M., Şanda, M. A. Determination of Antioxidant Capacity of Sphaerophysa kotschyana Boiss. International Symposium on EuroAsian Biodiversity (SEAB-2017). July 5-8 2017, MİNSK/ BELARUS


İLETİŞİM

Harran Üniversitesi Fen Edebiyat Fakültesi, S-Blok, Kat-2 
Osmanbey Yerleşkesi 63190 ŞANLIURFA / TÜRKİYE

Telefon: 0 414 318 34 61 (Dekanlık)
Fax: 0 414 318 35 41 (Dekanlık)


İŞBİRLİĞİ

  • Doç. Dr. Yusuf Kurt, birçok projesini Akdeniz Üniversitesi, Orman Bakanlığı ve North Carolina State Üniversitesi ile işbirliği içinde gerçekleştirmektedir.
  • Prof. Dr. Peng JIANG (University of Florida), Prof. Dr. Kerim GÜLYÜZ (Central Michigan University), Prof. Dr. Zhiqun Lin (Georgia Tech University), Asst. Prof. Emir Yasun (University of California), Prof. Dr. Eric McLamore (University of Florida), Prof. Nikolai Grigorievich Khlebtsov (Russian Academy of Sciences (IBPPM RAS))
  • Dr. Öğr. Üyesi Oya Akça çalışmalarının bir kısmını Orta Doğu Teknik Üniversitesi Nanobiotechnology R&D Laboratory ve Marmara Mems/Nems/Moems Araştırma ve Geliştirme Merkezi ile işbirliği içinde gerçekleştirmektedir.


LABORATUAR OLANAKLARI

  • Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümünün lisansüstü çalışmalar için kullanılabilecek bir araştırma laboratuvarı bulunmaktadır.
  • Bölümün araştırma projelerinin bazıları da Harran Üniversitesi, Merkezi Araştırma Laboratuvarının Moleküler Biyoloji Laboratuvarında hizmet alımı karşılığında yapılmaktadır.


PROJELER

  • Farklı Saklama Koşullarının Bazı Ağaç Türlerinin DNA Miktar ve Kalitesine Etkilerinin İncelenmesi. Yürütücü: Doç. Dr. Yusuf KURT. 2018-2019.
  • Integrating research, education and extension for enhancing southern pine climate change mitigation and adaptation. Yürütücü: Prof. Dr. Ross WHETTEN. USDA Coordinated Agricultural Project (CAP). 2015-2016.
  • The Collaborative Fir Gerplasm Evaluation (CoFirGE) Project. Yürütücü: Prof. Dr. John FRAMPTON. 991785 (NCSU). 2014-2016.
  • Breeding without Breeding on Forest Trees: A case study on Fraser Fir (Abies fraseri). Yürütücü: Dr. Yusuf KURT. Danışman: Prof. Dr. John FRAMPTON. 2219-Programme (TUBITAK). 2014-2016.
  • Scalable Nanomanufacturing of Reconfigurable Photonic Crystals. Yürütücü: Prof. Dr. Peng JIANG. (NSF) 1562861. 2016-2019
  • Biyomoleküllerin saflaştırılmasında kullanılacak manyetik nano partiküllerin üretimi. Yürütücü:  Dr. Ögrt.Üyesi Numan GÖZÜBENLİ. (BAP) 18206. 2018-2019
  • HÜBAK (Harran Üniversitesi Bilimsel Araştırmalar Koordinatörlüğü) 18150, Development of  Nanoparticle-based Point-of-Care Diagnostics  Platform for Determining  Alkaline Phosphatase Activity from Saliva. Yürütücü: Dr. Öğr. Üyesi Oya AKÇA
  • ODTÜ-BAP-ÖYP BAP-08-11-DPT 2002 K120510, Development Of Diagnostic Platforms For Single Nucleotide Polymorphism Detection. Oya AKÇA, Hüseyin Avni ÖKTEM
  • ODTÜ BAP-08-11-2011-01 Development of Next-Generation Detection Platforms for CBRN Applications. HA Öktem, O. Akça, D. Çam, M. Kavruk, K. Bilecen.
  • ODTÜ-BAP-ÖYP BAP-08-11-DPT 2002 K120510, Effect of Drought and Salt Stresses on Antioxidant Defense System and Physiology of Lentil (Lens culinaris M.) Seedlings. Oya AKÇA, Hüseyin Avni ÖKTEM
  • BOREN, BOREN-2009-Ç0217. Bor stresi altında buğday bitkisinin gen ifade profillerinin incelenmesi ve Tarımborun bu strese tepki üzerine etkilerinin moleküler seviyelerde belirlenmesi. Ercan Oya, Öktem HA, Yücel M, Eyidoğan F, Öz MT, Kayıhan C.
  • Geleneksel yöntemlerle Toros sedirinden (Cedrus libani Achille Richard) elde edilen katranın Biyoanaliz Kapsamında Fonksiyonel Bileşiklerin İzolasyonu ve Karakterizasyonunu ve Antioksidan Aktivitesinin Belirlenmesi. Yürütücü:Dr. Öğrt. Üyesi Abdussamat GÜZEL. 2018-2019


SEÇİLMİŞ YAYINLAR

  • Cinbilgel İ. and Kurt Y. 2019. Oregano and/or marjoram: Traditional oil production and ethnomedical utilization of Origanum species in southern Turkey. Journal of Herbal Medicine. https://doi.org/10.1016/j.hermed.2019.100257.
  • Kurt Y, Frampton J, Isik F, Landgren C. and Chastagner G. 2016. Variation in needle and cone characteristics and seed germination ability of Abies bornmuelleriana and Abies equi-trojani populations from Turkey. Turkish Journal of Agriculture and Forestry 40: 169-176.
  • Gözübenli N,Yasun E, Dilsiz, N, /Hybrid nanomaterial: biocolloidals’’, Journal of Turkish Biology 41, 5 2017.
  • X Liu, N Gozubenli, B Choi, P Jiang, T Meagher, B Jiang, \Templated fabrication of periodic arrays of metallic and silicon nanorings with complex nanostructures", Nanotechnology 26, 055603 2015.
  • Bayraç AT, Akça O, Eyidoğan F, Öktem HA.Target-specific delivery of doxorubicin to human glioblastoma cell line via ssDNA aptamer (2018). Journal of Biosciences,  43 (1): 97–104
  • Bulut O, Akça O, Öktem HA. Development of a nucleic acid based lateral flow assay for detection of Salmonella spp. (2019),  Submitted.
  • Yılmaz R, Akça O, Baloğlu MC, Öz MT, Öktem HA, Yücel M (2012) Optimization of yeast (Saccharomyces cerevisiae) RNA isolation method for real-time quantitative PCR and microarray analysis. Afr. J. Biotechnol. 11(5): 1046-1053.
  • Celikkol Akcay U, Ercan O, Kavas M, Yildiz L, Yilmaz C, Oktem HA, Yucel M (2010) Drought-induced oxidative damage and antioxidant responses in peanut (Arachis hypogeal L.) seedlings. Plant Growth Regul. 61:21-28
  • Güzel, A., Akşit, H., Elmastaş, M., Erenler, R., 2017. Bioassay guided isolation and identification of antioxidant flavonoids from Cyclotrichium origanifolium (Labill.) Manden. And Scheng. Pharmacognosy Magazine. 13(50), 316-320


ÜRÜNLER

  • Doç. Dr. Yusuf Kurt’un yürütücüsü olduğu “Farklı Saklama Koşullarının Bazı Ağaç Türlerinin DNA Miktar ve Kalitesine Etkilerinin İncelenmesi” isimli projenin bir sonraki aşamasında ticarileşme potansiyeli olan bir DNA izolasyon kitinin geliştirilmesi hedeflenmektedir.
  • Dr. Öğr. Üyesi Oya Akça’nın yürütücüsü olduğu “Alkalen Fosfataz Aktivitesini Tükürük Örneğinden Belirleyebilen Nanoparçacık Temelli Hasta Başı Tanı Platformunun Geliştirilmesi” başlıklı projenin ileri aşamalarında periodontal doku hasarında önemli bir biyobelirteç olarak kabul edilen Alkalen Fosfataz (ALP) aktivitesinin tükürük örneğinden nanobiyoteknoloji yaklaşımları kullanılarak hızlı ve güvenilir tespitinde kullanılacak invaziv olmayan bir hasta başı (Point-of-Care) tanı platformunun geliştirilmesi ve ticari ürün haline getirilmesi amaçlanmaktadır.


YÜRÜTÜCÜLER

Doç. Dr. Yusuf KURT

Dr. Öğr. Üyesi Oya AKÇA

Dr. Öğr. Üyesi Abdussamat GÜZEL

Dr. Öğr. Üyesi Numan GÖZÜBENLİ